Neben zahlreichen mit den bekannten Siegeln Demeter, Bioland, Deutsches Bio-Siegel und EU Bio-Siegel gekennzeichneten Artikeln bietet EDEKA mit EDEKA Bio ein eigenes Label.

Die Eigenmarke EDEKA Bio garantiert bestens kontrollierte Qualitätsprodukte aus ökologischer Landwirtschaft, welche mit dem Biokontrollsiegel und eine Ökokontrollstellennummer versehen sind. Diese Merkmale belegen, dass die Richtlinien der EG-Öko-Verordnung erfüllt werden. Inhalt dieser Verordnung ist u. a. der Gehalt von Bio-Rohstoffen, nahezu Freiheit von Pestizidrückständen und der Verzicht auf chemische Düngung. Fleisch muss aus artgerechter Haltung stammen, Tierarzneimittel werden kaum eingesetzt, gentechnisch veränderte Materialien sind verboten. Auf Zusatzstoffe wird weitgehend verzichtet.

Durch die Kooperation von EDEKA mit ALNATURA wurde das umfassende Sortiment an Bio-Produkten um eine weitere sehr namhafte Marke ergänzt.